在轉入流程上，兩款產品流程都相對簡單，依據網絡情況，5-10秒之內便可以完成申購。不過考慮每天打開微信的頻率要高于支付寶錢包，理財通在隨時隨地轉入以及隨時查看收益方面，較余額寶更有吸引力。
　　不過，目前也有相當比例的投資者每天起床的第一件事就是——打開支付寶錢包查看收益。今年2月12日，余額寶沒有在凌晨發放收益，成為互聯網圈大事件。
　　轉入額度上，余額寶更勝一籌。用余額轉入余額寶無額度限制，用借記卡快捷轉入余額寶不同銀行額度不同。目前借記卡快捷轉入支持工行、建行、農行、郵儲、中行5家無限額支付，其他銀行額度大多在5萬元以內，每個賬戶資金不超過100萬元。而微信理財通轉入時必須要綁定銀行卡，多數銀行對轉賬額度做出了限制，甚至有部分銀行規定每日每筆轉賬額度不得超過5000元。　
　　轉出額度方面，微信理財通每個賬戶每日轉出金額不超過6000元，每日可轉出3次；余額寶電腦端證書用戶：單筆5萬元，單日5萬元，單月20萬元；非證書用戶：單筆2萬元，單日2萬元，單月20萬元；無線端：單筆5萬元，單日5萬元，單月20萬元。在轉出次數和額度限制上，一個賬戶一天最多可操作3次轉出至銀行卡。
　　到賬時間，微信理財通支持工行、農行、建行等11家銀行2小時到，其他銀行1-3天內到賬。余額寶單筆5萬元以下（含5萬），第二個自然日24點前到賬；單筆高于5萬元，提交后的一個工作日內24點前到賬；實時到賬：僅支持中信、光大、平安、招行卡通；2小時到賬：僅支持無線，日累計5萬以內（含），且在該卡服務時間內。
　　收益率上，前期一度理財通的收益率高出余額寶。不過，最新兩者的收益率均逐步回落，理財通的收益優勢也逐漸消失。
　　在消費體驗上，余額寶優勢更為明顯，其可以直接用來消費、購物，理財通不可以，除非你先轉出到銀行卡。
　　綜上，余額寶在額度上、轉出到賬時間以及消費可用性上占優，理財通在操作便捷性上更勝一籌。