5月12日和13日，農業部孫政才部長主持召開會議，緊急安排部署農業系統抗震救災和抓好當前農業生產工作。會議決定，成立農業部抗震救災指揮部，孫政才部長任指揮長，相關分管副部長任副指揮長，機關各有關司局主要負責同志任成員。

　　孫政才部長強調，農業系統要緊急動員起來，當前要重點做好六個方面的工作：
　　第一，要緊急行動，全身心投入到農業抗震救災工作中去。要根據災情發展情況，及時啟動相應救災應急響應，指導農業抗災救災工作。機關各司局、地方各級農業部門，特別是災區農業部門要堅決貫徹落實黨中央、國務院的部署，在當地黨委、政府的堅強領導下，把做好農業抗震救災、保證農產品市場供給作為當前壓倒一切的大事。主要負責同志要靠前指揮，要做好災區群眾思想政治工作，維護災區穩定。
　　第二，要摸清受災情況，判斷災害走勢，為救災和恢復農業生產提供決策依據。災區農業部門要加強災情調度，切實做好災情統計工作，努力做到數據準、情況明。要組織農業技術人員，深入災區農業生產第一線，實地了解受災情況，科學評估損失程度，在掌握第一手情況的同時，認真研究和現場指導農業救災和恢復生產工作。對可能發生的次生災害，要認真分析，科學應對。要加強應急值守，實行24小時值班，隨時了解情況，做好信息匯總和上報工作。要加強新聞宣傳，正確引導輿論。
　　第三，要加強疫情監測，切實做好重大動植物疫病防控工作。要強化環境消毒、強化疫情監控、強化無害化處理、強化災后免疫，強化檢疫監管，防止病死畜禽流入市場，確保大災之后無大疫。要積極推動災區農村開展愛國衛生運動，保持環境衛生。要組織好消毒藥品和疫苗的調運工作，保證災區需要。要把此項工作放在農業救災的突出位置。
　　第四，要樹立全國一盤棋思想，確保災區市場供應。要加強糧食和鮮活農產品調運，繼續執行好農產品綠色通道政策，保證災區市場供應。非災區要發揮“一方有難、八方支援”的優良傳統，立足當前抗震救災大局，切實抓好農業生產，積極支持災區農業抗災救災工作。要動員社會力量參與救災工作。
　　第五，要著手制定重建方案，及早籌劃災后恢復農業生產工作。農業部和災區各級農業部門要立足當前，著眼長遠，科學謀劃，統籌安排災后重建工作。要科學分析農業災情，合理評估農田設施、畜禽圈舍、養殖塘壩等基礎設施坍塌損毀情況，選擇適宜的抗災救災技術路線，擬定符合當地實際的生產資料等各項物資保障預案，制定具有長遠眼光的基礎設施災后重建方案。加強與有關部門的協調溝通，爭取多方支持，全力做好資金、技術、物資、施工等各項準備，盡早啟動災后重建和恢復生產工作，力爭抗災奪豐收。
　　第六，要統籌兼顧，全力抓好當前農業生產工作。一手抓抗震救災，一手抓當前生產。要精心組織、周密安排，加強夏季糧油作物田間管理，組織好小麥跨區機收，確保顆粒歸倉，保證夏糧獲得好收成。