4月16日，國家民用航空局對東航云南分公司返航事件作出調查結論及處罰決定，17日，東航隨即在其門戶網站上發表道歉聲明，令這場轟轟烈烈的“返航門”事件暫告一段落。

賠款丟航線

　　3月31日，東航云南分公司從昆明起飛的18個航班中途返航。4月1日，東航云南分公司又有3個航班因不明緣故返航，事件隨即像滾雪球般越滾越大。民航局工作組4月5日奔赴云南，對東航“返航門”事件展開調查。
　　4月16日，調查組認定，東航云南分公司連續兩日的返航事件，主要是東航云南分公司少數飛行人員無視旅客權益所造成的一起非技術原因的返航事件。依據相關航空法規，民航局對東航開出一份罰單，要求東航上繳150萬元罰款，并責令東航在3個月內完成相關設備的改裝升級，恢復QAR譯碼設備的正常工作。
　　從150萬元的數額來看，民航局頗有些殺雞給猴看的意味。此前，一名網友戲謔地算了一筆賬：單從3月31日，18架飛機因機票造成的直接損失至少就有 30萬元。因飛機無故返航導致的車旅費、食宿費等其他事務造成的間接損失至少在100萬元以上。如果按照我國精神損害賠償的司法實踐，那么，千名乘客本次精神損害賠償費，與直接損失、間接損失的總和至少在1000萬元以上。
　　對東航來說，150萬元的賠償金也許只是隔靴搔癢，但停止東航云南地區部分航線、航班的經營權，交由其他航空公司經營的處罰，才真正戳中東航的痛處。東航新聞發言人在電話里告訴記者，對于哪家公司將接手云南地區的航班、航線，目前要等民航局的消息。至于這次云南停航對東航造成的經濟影響，東航方面不愿表態。

東航態度大轉彎

　　“我們在門戶網站上發布了一份公開、真誠的聲明”，東航新聞發言人對記者說。
　　東航稱，返航事件暴露了公司在管理上的問題，對于此次事件給社會造成的不良影響和給旅客帶來的諸多不便，再次表示深深的歉意，并承諾，對涉及旅客權益的問題將予以妥善處理。
　　而在3月31日返航事件剛發生時，東航云南分公司態度強硬，稱“返航是因為天氣原因，飛行員集體罷飛的情況不屬實”。

賠償事宜有待進一步調查

　　民航局在返航事件調查結論及處罰決定里提出，對云南分公司部分航班返航的非技術原因進行深入調查，依據相關法律法規，對有關責任人進行嚴肅處理，并要求將結果上報。
　　返航事件已經過去近20天，在民航局和東航形式上圓滿解決事件的背后，還遺留下兩個備受關注的問題。焦點之一是，對肇事飛行員的處罰。據媒體報道，目前已有11名飛行員暫時停飛接受調查。“至于具體對飛行員的處理，一有消息，我們會立即通報給大家”，東航新聞發言人這樣回答記者的提問。
　　大家關注的另一個焦點，無疑就是對受損乘客的具體賠償。民航局已提出要求，東航應盡快妥善處理好此次返航事件涉及的旅客權益問題。