創業板上市企業具有良好的成長性，但同時也蘊含巨大的風險，因此，創業板在不斷吸納優質上市公司的同時，也要淘汰那些劣質的公司。退市制度可能影響到一小部分投資者的利益，但整體而言，它有利于市場總體利益與長遠利益的實現。
　　不過，既然創業板退市制度會對一部分投資者的利益造成傷害，在實施過程就有必要優先考慮保護投資者利益，最大程度地減少對投資者利益的傷害。
　　創業板實施退市制度，首先，要對中小投資者實施“事前保護”。“事前保護”主要是指加強投資者教育，特別是讓投資者對創業板公司的退市風險有足夠的認識，從而使其對自身所需承擔的正常市場風險有心理預期。
　　其次，要對投資者利益進行“事中保護”。對那些業績或者信息披露欠佳的上市公司，應強化信息披露監管，使投資者在第一時間了解到公司的運作情況以及經營中遇到的風險，以便盡快作出較為理性的投資決策。目前，深交所已提出了完善創業板退市制度的初步方案，擬從增加退市標準、完善恢復上市審核標準、縮短退市時間、改進退市風險提示方式、設立單獨的板塊和退市后的去向安排等方面，對創業板退市制度進行完善。在這些措施中，“改進退市風險提示方式、設立單獨的板塊和退市后的去向安排”等，都是對投資者利益的“事中保護”。
　　此外，創業板公司退市的“事后保護”更為重要。如果公司是因為經營失敗而退市，投資者自己承擔損失當然無可厚非，但如果公司是因為實際控制人或控股股東、董事、高管違法違規致使公司經營失敗而退市，那么就需要建立民事訴訟賠償制度以及退市責任追究機制，實現對投資者利益的保護。對包裝上市、財務造假或惡意退市的，損失應由公司控股股東及保薦機構、律師事務所、會計師事務所等中介機構共同承擔。試想一下，如果投資者民事賠償制度能夠做到讓問題公司無利可圖甚至傾家蕩產，那么上市公司違規行為就將大大減少。因此，建立民事訴訟賠償制度以及退市責任追究機制，是對投資者利益保護最有效的事后措施。