上海自貿試驗區掛牌兩個月來，上海海關監管創新試點穩步開展，其在區內實施的“先進區、后報關”試點，已為6家試點企業共辦理業務53起，總貨值1.1億美元。
　　10月初，上海海關在自貿試驗區內選擇了6家信譽良好的企業啟動一線進境貨物“先進區、后報關”試點。和過去傳統的“先報關、后進區”模式相比，試點車輛過卡口入區更為便捷，平均過卡時間不到1分鐘。據企業測算，新模式下貨物入區通關時間可縮短2至3天，物流成本平均減少10%。這一模式受到企業歡迎，11月“先進區、后報關”試點31起，貨值6743.3萬美元。
　　為了推進貿易轉型升級，上海海關積極推動相關業務的功能拓展，培育保稅展示交易、保稅維修、融資租賃、期貨保稅交割、跨境電子商務等貿易新型業態和功能。11月下旬，上海海關在浦東國際機場啟動航運快件國際中轉集拼業務試點，這是繼上海洋山港啟動國際貨物中轉集拼業務后，上海在航空貨運領域的又一突破，能有效提升上海作為國際航運中心的服務能級，為自貿試驗區下一步發展奠定基礎。
　　自貿試驗區掛牌兩個月來，在海關新注冊的企業達243家，同比增長99.2%，其中，外高橋保稅區186家、浦東機場綜合保稅區31家、洋山保稅港區26家，主要涉及國際貿易類、金融類等行業；截至目前，自貿試驗區內海關注冊企業總數已達5402家。
　　同時，上海海關通過深化區域通關改革，不斷提升上海口岸的輻射功能，助推上海成為長江流域乃至全國的中轉支撐基地，為加快長江經濟帶發展提供更好的通關支持。
　　今年6月，上海海關與全國所有直屬海關建立起區域通關合作機制，實現區域通關改革全覆蓋。在此基礎上，上海海關聯手長江流域海關共同推進通關作業無紙化改革，例如實行上海、南京兩地海關通關無紙化企業互認，引導企業共同參與兩地海關的改革試點；進一步簡化上海、南京海關之間的轉關手續，取消出口轉關紙質關封傳遞等，不斷提升上海口岸服務長三角的水平。
　　11月1日，作為“屬地申報、口岸驗放”升級版的“屬地申報，屬地放行”模式在南京海關和上海海關正式開通。符合條件的江蘇企業在主管地海關——南京海關辦理通關手續后，南京海關會把電子放行信息直接發送到上海口岸的港務部門，企業無需再跑上海海關就可從上海港區提貨。這一新模式圓了企業“把上海口岸延伸到家門口，不出家門大通關”的夢。目前，“屬地申報，屬地放行”模式在上海和南京、南昌、武漢等長江流域海關之間運行順暢。
　　此外，為了更好發揮上海的樞紐港作用，為本土出口企業打造境內支撐基地，上海海關還繼續穩步推進啟運港退稅政策試點，加強與武漢、青島兩個啟運地海關的聯系，跟蹤實施情況，及時進行評估，強化監管合力。
　　今年以來，上海海關共辦理區域通關進出口業務11.85萬票，貨值262.99億美元。可在上海各海空運口岸適用“屬地申報、口岸驗放”通關模式的本地及外地企業近28745家。辦理以上海海關為口岸地海關的轉關運輸貨物193.94萬批，貨重3936.92萬噸。